Формально, вам необходимо было подать налоговую декларацию до 30 апреля 2009 года ( в соответствии с п.1 статьи 229 Налогового Кодекса).
В соответствии с подпунктом 1 пункта 1 статьи 220 Налогового Кодекса при продаже имущества, которое находилось в собственности три года и более, имущественный налоговый вычет предоставляется в сумме, полученной при продаже указанного имущества.
Таким образом, так как акции находились в собственности более трех лет, от уплаты налога вы освобождаетесь.